Ancien élève de l'Ecole des mines de Paris (promotion 1951). Docteur-ingénieur (1961) puis docteur es sciences (1968, Univ. de Paris-Orsay). Ingénieur civil des mines.
Yves Quéré est un physicien qui a été professeur et directeur de l'enseignement à l'Ecole polytechnique. Il est membre de l'Académie des sciences depuis 1991. Il en a été pendant 8 ans le délégué aux relations internationales, et co-président de l'InterAcademy Panel (depuis 2000).
Il a travaillé avec Georges Charpak et Pierre Léna à la rénovation de l'enseignement de la physique à l'Ecole et au Collège, via La main à la pâte.