Ancien élève de l'Ecole polytechnique (promotion 1875, sorti classé 99 sur 254 élèves) et de l'Ecole des Mines de Paris (promotion 1877). Ingénieur civil des Mines.
Fils de Émile KELLER, (1828-1909, député catholique d'Alsace, père de 14 enfants dont 4 dans les Ordres religieux, fondateur des Cercles Catholiques d'Ouvriers), et de Mathilde HUMANN, fille d'un maire de Strasbourg. Beau-frère de Alfred SAGLIO.
Père de Cécile KELLER (mariée en 1919 à Joseph AUBERT (1899-1947 ; X 1908 fils de Henri Joseph AUBERT avocat au conseil d'Etat et à la Cour de cassation), devenu ingénieur en chef de génie maritime, directeur général de la Société alsacienne de construction mécanique).
Frère de François KELLER (1871-1914 ; X 1890).
Marié à Hélène Laure Marie Françoise LETELLIER DELAFOSSE.
Père de Louis Alfred Émile KELLER (1888-1916 ; X 1908, capitaine d'Artillerie mort pour le France).
Il est aussi le petit-neveu de François Antoine Édouard KELLER (1803-1874 ; X 1821, célèbre ingénieur hydrographe de la marine, originaire de Wissembourg).