Ancien élève de l'Ecole polytechnique (promotion 1854 ; entré classé 106ème, sorti sans diplôme) et de l'Ecole des Mines de Paris (il est obligé de suivre le cours préparatoire en 1855-56 ; admis comme élève externe le 8/11/1856, il est rayé le 2/6/1857 et réadmis en 1ère année en septembre 1857 ; il donne définitivement sa démission en avril 1858. Il n'obtient donc pas le diplôme d'Ingénieur civil des mines).
Fils de Pierre Achille Marie CHAPER (1795-1874) et de Antoinette Marie Henriette TEISSEIRE.
Maurice Armand CHAPER a travaillé dans les chemins de fer, les travaux publics, la métallurgie, la géologie, la paléontologie, l'exploration minière au Venezuela, l'étude du canal de Panama, et a présidé la Société zoologique de France. Il a également été adjoint au maire du 5ème arrondissement à Paris.
A l'Ecole des mines, il avait polémiqué avec Edmond HÉBERT.
Il a aussi été capitaine de la garde nationale (1870), puis nommé lieutenant-colonel en 1871.
Il a fait de nombreux voyages dans des pays lointains au cours desquels il a recueilli des échantillons envoyés à l'Ecole des mines et au Muséum, et a publié ses observations.